教育用顕微鏡として一般的に使用されるのは、正立顕微鏡と実体顕微鏡です。

染色された組織病理切片などのスライド標本の観察には、正立顕微鏡が使用されます。正立顕微鏡では高倍率・高解像度の観察が可能です。そのため、対物レンズ先端と標本の間（作動距離）は短くなります。

実体顕微鏡は、実験動物の解剖や岩石・化石などの地質サンプルの観察において、大型標本を立体視することができます。作動距離が数十mmあるため、観察しながらサンプルへのアクセスや操作を容易に行うことができます。

教育用顕微鏡は、高度な光学性能と過酷な使用環境にも耐える堅牢性を両立させる必要があります。

非常に軽量であることに加え、底面には持ち手があり、背面にはアームを備えているなど、持ち運びやすさや高い棚への収納のしやすさを追求して設計されています。ECLIPSE SiとECLIPSE Eiは、電源コードを背面のコードハンガーに巻き付けてすっきりと収納することができます。

また、ECLIPSE SiとECLIPSE Eiは、対物レンズと標本の衝突を防ぐステージ上下動ストッパーを搭載しています

顕微鏡デジタルカメラDigital Sight 1000は、モニターとマウスを接続するだけで、顕微鏡のライブ像表示、画像取得、さらには長さなどの簡易計測が可能です。ウェブ会議サービスと組み合わせることで、オンライン授業を行うことも可能です。

また、教師の顕微鏡の画像を生徒が参照することや、生徒の顕微鏡操作を教師が確認することができるため、ソーシャルディスタンスをとりながら授業を進めることも可能です。