ECLIPSE Ji

Smart Imaging System

인터뷰

고객 인터뷰 공초점 현미경을 활용한 스마트 자동화:
ECLIPSE Ji, 3D 세포 연구의 미래를 바꾸다

AdHuCell 플랫폼 및 생명과학 연구소
몽스 대학교(UMONS)

실뱅 가브리엘(Sylvain Gabriele) 교수, SYMBIOSE Lab

벨기에 몽스 대학교(UMONS)의 실뱅 가브리엘(Sylvain Gabriele) 교수는 세포가 기계적 힘을 어떻게 감지하고, 이에 어떻게 반응하며 그 기억을 어떻게 유지하는지를 연구하는 기계생물학 분야의 선도적인 연구자입니다.
그가 이끄는 SYMBIOSE 연구실과 공동 설립한 AdHuCell 플랫폼은 첨단 생체공학 및 3D 세포 배양 기술을 결합하여, 세포 이동, 조직 조직화, 암 전이 등의 핵심 생물학적 과정을 물리적 관점에서 탐구하고 있습니다.

우리는 가브리엘 교수와 최근 그의 연구실에 설치된 니콘 ECLIPSE Ji-AX 공초점 통합 시스템이 어떻게 복잡한 3차원 생물학적 시스템에 대한 새로운 통찰력을 제공하고, 이미징, 기계생물학, 공학적으로 제작된 조직 모델의 접점에서 연구를 발전시키고 있는지에 대해 이야기를 나누었습니다.

기계생물학 분야의 연구 배경 및 전문성

- 우리는 세포가 “힘”을 감지하고 이에 반응하는 메커니즘을 규명하는 최첨단 연구 분야를 심층적으로 살펴봅니다.

물결 모양 기질 위의 곡선형 상피 조직
매딘-다비 개 신장(MDCK) 세포

액틴 표지용 알렉사 플루오르 488 팔로이딘 (녹색)
DNA 표지용 호에스트 33342 (파란색)
이미지 제공: 몽스 대학교 Marine LUCIANO 박사 및 Sylvain GABRIELE 박사

자신을 소개해 주시고, 전문 분야와 연구 주제에 대해 설명해 주시겠어요?

저는 벨기에 몽스 대학교의 실뱅 가브리엘 교수입니다. 현재 본교 생명과학연구소(Research Institute for Biosciences) 소속 SYMBIOSE 연구실을 이끌고 있으며, AdHuCell 플랫폼을 공동으로 운영하고 있습니다. 저희 연구는 기계생물학, 특히 기계적 힘이 세포의 행동을 어떻게 형성하는지에 초점을 맞추고 있습니다. 저희는 세포가 기질의 강성, 제한, 곡률과 같은 물리적 신호를 어떻게 감지하고, 이에 적응하며, 그 기억을 유지하는지 연구합니다. 이러한 질문을 해결하기 위해, 저희는 첨단 생체재료, 공학적으로 설계된 3D 마이크로시스템, 고해상도 이미징 기술을 결합합니다. 이러한 통합적인 접근 방식을 통해, 기계적 상호작용이 조직 형태 형성, 암 침습, 재생과 같은 주요 생물학적 과정을 어떻게 조절하는지 규명할 수 있습니다.

ECLIPSE Ji를 활용한 3D 이미징 과제 극복

- 본 논문에서는 ECLIPSE Ji의 뛰어난 사용 편의성과 자동화 기능이 복잡한 3D 배양 시료의 영상 촬영 과정에서 직면한 과제들을 어떻게 극복했는지 살펴봅니다.

ECLIPSE Ji를 사용하기 전, 3D 세포 배양이나 복잡한 매트릭스를 다룰 때 주로 어떤 이미징 관련 어려움을 겪으셨나요?

우리 연구팀은 세포 생물학의 핵심적인 의문을 해결하기 위해 맞춤형 마이크로시스템, 3D 세포 배양 및 생체공학 매트릭스 개발에 상당한 노력을 기울이고 있습니다. 우리는 시료 탐지부터 이미지 획득에 이르는 일상적인 단계를 자동화하면서도, 방대한 3D 영역 전반에 걸쳐 고품질의 광학 단면 촬영을 유지할 수 있는 이미징 시스템이 필요했습니다. 니콘 ECLIPSE Ji-AX는 사용자의 개입을 최소화하면서도 복잡한 시료를 빠르고 안정적으로 촬영할 수 있게 함으로써 이러한 과제를 해결해 줍니다.

스마트 이미징 시스템 ECLIPSE Ji

엘라스토머(PDMS)로 제작되어 유리에 접합된 미세유체 회로

ECLIPSE Ji를 처음 어떻게 알게 되셨나요? 그리고 직접 사용해 보기로 결심하게 된 계기는 무엇이었나요?

니콘 유럽(Nikon Europe)과의 협력을 통해, 저희 연구실은 Ji-AX가 유럽에서 출시된 직후 이를 최초로 탐구한 연구실 중 하나가 되었습니다. 저는 라이덴에 위치한 니콘 바이오이미징 랩(Nikon Bioimaging Lab)을 방문해 NSPARC 실험을 진행하던 중 이 시스템을 처음 접했습니다. 실제로 작동하는 모습을 보니 정말 큰 영감을 받았는데, 바로 우리가 찾던 바로 그 직관적이고 자동화된 이미징 워크플로우를 제공해 주었기 때문입니다. 저희는 특히 새로 설립된 AdHuCell 플랫폼 내의 오가노이드 및 기계생물학 프로젝트에 있어, 이 시스템이 하이콘텐츠 이미징과 첨단 3D 연구를 연결하는 가교 역할을 할 수 있는 잠재력을 즉시 인식했습니다.

ECLIPSE Ji를 처음 사용했을 때 어떤 구체적인 특징이 특히 눈에 띄었나요?

먼저, 스마트 자동화 기능입니다. 이 시스템은 시료를 감지하고, 조명과 초점을 조정하며, 단 몇 초 만에 이미징 조건을 최적화할 수 있습니다.

이 시스템은 놀라울 정도로 직관적이어서, 학생과 연구자들이 기기 설정에 신경 쓰기보다 실험 자체에 집중할 수 있게 해줍니다. 또한 이 시스템이 제공하는 유연성도 큰 장점입니다. 사용자는 ‘스마트 어세이(Smart Assays)’를 활용해 완전 자동 모드로 작동할 수도 있고, 더 정밀한 제어가 필요할 때는 고급 AX 공초점 이미징 모드로 원활하게 전환할 수도 있습니다.

기계생물학 연구에서 3D 분석의 혁신

- 새로운 영상 기법은 세포 초미세 구조와 조직 수준의 역학 사이의 간극을 메워, 복잡한 생물학적 시스템에 대한 더 깊은 이해를 가능하게 한다.

인간 유방 상피 세포 (MCF10-A)
알렉사 플루오르 488 팔로이딘(녹색)으로 염색된 F-액틴, 호에스트 33342(파란색), 알렉사 플루오르 594(주황색)로 표지된 피브로넥틴
이미지 제공: 몽스 대학교 Yohalie KALUKULA 박사 및 Sylvain GABRIELE 박사.

ECLIPSE Ji는 귀하의 기계생물학 연구에 어떤 기여를 했거나, 연구를 어떻게 발전시켰습니까?

이는 3D 세포 행동의 포착 및 분석 방식을 혁신적으로 변화시켰습니다. 넓은 시야를 제공하는 공초점 모드를 활용하면, 액틴 배열이나 핵 변형과 같은 미세한 구조까지 선명하게 포착하면서도 미세 조직 전체나 이동 중인 세포 집단을 영상화할 수 있습니다. 이러한 멀티스케일 분석 능력은 세포 수준의 구조와 조직 수준의 역학을 연결하는 데 필수적이며, 이는 우리 연구의 핵심을 이룹니다.

인간 유선 상피 세포(MCF10-A)의 구형체.
알렉사 플루오르 488 팔로이딘으로 염색한 F-액틴(녹색), 
E-카데린 면역염색(빨간색), 호에스트 33342로 염색한 세포핵(파란색).
이미지 제공: 몽스 대학교 Marine LUCIANO 박사 및 Sylvain GABRIELE 박사.

교수님의 연구실에서 ECLIPSE Ji를 통해 가장 큰 효과를 본 응용 분야나 실험은 무엇입니까?

유방암 구형체의 역학 및 소형 세포 군집의 제한된 이동에 관한 우리의 최근 연구는 이 시스템 덕분에 특히 큰 성과를 거두었습니다.

예를 들어, 이제 우리는 구형체의 크기나 기계적 응력 하에서의 변형에 따른 세포골격 재구성을 추적할 수 있을 뿐만 아니라, 이전에는 수집하는 데 너무 많은 시간이 소요되었던 고내용 데이터셋을 생성할 수 있게 되었습니다.

특히 복잡한 3D 세포 배양이나 기계생물학 실험의 경우, ECLIPSE Ji의 인터페이스와 조작 방식이 얼마나 사용자 친화적이라고 생각하셨나요?

사용자 친화성이 매우 뛰어납니다. 인터페이스가 각 단계를 단계별로 안내해 주므로, 전문가가 아닌 사용자도 쉽게 이용할 수 있습니다.

이 도구는 특히 젊은 연구자들을 교육하는 데 매우 적합하면서도, 정량적 생물물리학 및 기계생물학 실험에 필요한 수준의 정밀도와 재현성을 동시에 제공합니다.

층류 후드 내에서 시료를 조제한 후, 96웰 플레이트에서 NIS-Elements Sample Navigation을 수행하고 공초점 현미경 촬영을 진행합니다.

ECLIPSE Ji 및 SE 소프트웨어에 포함된 분석법을 사용해 보신 적이 있으신가요?

만약 그렇다면, 어떤 경험을 하셨나요?

네, 저희는 Ji 및 NIS-Elements 소프트웨어에 통합된 “Smart Assays” 기능을 정기적으로 사용하고 있습니다. 이 기능은 매우 직관적이어서 단 몇 번의 클릭만으로 표준화된 이미징 워크플로를 실행할 수 있게 해줍니다. 이 분석법은 특히 일상적인 실험에 매우 적합하며, 저희의 일상적인 워크플로를 대폭 간소화하여 이미지 획득 및 분석 과정을 더욱 견고하고 재현성 있게 만들었을 뿐만 아니라, 전문 지식 수준에 관계없이 모든 사용자가 쉽게 활용할 수 있도록 해주었습니다.

NIS-Elements Smart Experiment

분석 결과 화면

자동화를 통한 재현성 및 사용 편의성 향상

- 이미징 워크플로우를 표준화함으로써, 자동화는 일관된 데이터 품질을 보장하여 실험을 더욱 효율적으로 만들고 모든 사용자가 쉽게 이용할 수 있게 합니다.

ECLIPSE Ji를 사용하는 신규 사용자에 대한 교육은 어떠셨나요?

ECLIPSE Ji에 대한 교육은 일반 전동 현미경에 대한 교육과 비교했을 때 어떤가요?

Ji를 사용하는 신규 사용자를 교육하는 것은 기존의 전동식 현미경에 비해 놀라울 정도로 쉽습니다. 

사용자 인터페이스는 단계별 안내가 제공되고 직관적이며, 많은 단계가 자동화되어 있어 사용자는 금세 자신감을 갖게 됩니다. 이 덕분에 실험실 신입 구성원들에게 이미징 기술을 소개하는 방식이 완전히 바뀌었으며, 그들은 거의 즉시 신뢰할 수 있는 데이터를 생성할 수 있게 되었습니다.

접착성 미세패턴 위의 인간 유방 상피 세포(MCF10-A).
Alexa Fluor 488 Phalloidin(녹색)으로 염색한 F-액틴과 DNA 염색을 위해 Hoechst 33342(파란색)로 염색한 것
이미지 제공: 몽스 대학교 Yohalie KALUKULA 박사 및 Sylvain GABRIELE 박사

왼쪽 이미지: 인간 진피 섬유아세포. 
 ・
Alexa Fluor 594가 결합된 팔로이딘으로 염색된 F-액틴 (빨간색)
 ・γH2AX 면역염색 (녹색)
 ・Hoechst 33342로 염색된 핵 (파란색)
이미지 제공: Roaxane AUCOUTURIER 및 몽스 대학교 Sylvain GABRIELE 박사

이 현미경을 사용하기 시작한 이후 재현성이나 데이터 일관성 측면에서 개선된 점이 있었나요?

자동화 및 사전 정의된 영상 촬영 프로토콜을 통해 모든 사용자가 일관된 조건에서 데이터를 수집할 수 있게 되어, 세션 간 및 조작자 간의 변동성을 최소화합니다. 이는 특히 과거에는 조도나 초점의 미세한 차이가 결과에 영향을 미치던 장기간 3D 배양 실험에서, 데이터 세트의 재현성과 일관성을 크게 향상시켰습니다. 예를 들어, 이제 우리는 γH2AX 염색과 “스마트 어세이(Smart Assays)”를 결합하여 DNA 손상에 대한 보다 견고하고 신뢰할 수 있는 측정 결과를 얻고 있습니다.

공초점 시스템의 통합을 통해 가능해진 멀티스케일 분석

- 신속한 선별 검사부터 고해상도 영상 촬영에 이르기까지, 통합 워크플로는 다양한 규모에 걸쳐 원활하고 효율적인 분석을 지원합니다.

ECLIPSE Ji에는 지금까지 사용해 보신 다른 현미경들과 차별화되는 독특하거나 혁신적인 점이 있나요?

자동화, 활용성, 광학 성능이 조화를 이룬 시스템입니다. 동일한 플랫폼 내에서 일상적인 이미징에서 첨단 공초점 이미징으로 이토록 매끄럽게 전환할 수 있는 시스템은 거의 없습니다. 저희에게 이 시스템은 일상적으로 사용하는 현미경일 뿐만 아니라, 최첨단 연구를 가능하게 해주는 도구이기도 합니다.

물결 모양 기질 위의 곡선형 상피 조직
매딘-다비 개 신장(MDCK) 세포

왼쪽: 액틴 표지용 알렉사 플루오르 488 팔로이딘(녹색) 및 DNA 표지용 호크스트 33342(파란색)
오른쪽: 세포막 표지자(빨간색) 및 DNA 표지용 Hoechst 33342(파란색)
이미지 제공: 몽스 대학교 Marine LUCIANO 박사 및 Sylvain GABRIELE 박사

ECLIPSE Ji와 AX 공초점 시스템의 호환성이 3D 배양 또는 생체공학 마이크로시스템 연구 능력을 향상시켰습니까? 그렇다면, 어떤 면에서 그렇습니까?

물론입니다. Ji-AX는 당사의 AX 공초점 시스템 및 고배율 실리콘 이멀젼 대물렌즈와 완벽하게 연동됩니다. 최근 저희는 이 장비를 활용하여 제한된 공간에서의 세포 이동 중 액틴 코르텍스가 기계적 기억의 안정화에 어떻게 기여하는지 조사했습니다. 현재는 AX 공초점 모드에서 Ji의 성능을 활용하여, 건강한 세포와 종양 세포로 구성된 곡선형 상피 조직 및 유방 스페로이드 내에서 세포 간 상호작용과 복잡한 세포골격 구조를 연구하고 있습니다. Ji를 이용한 신속한 이미징부터 고해상도 AX 공초점 촬영에 이르는 이 워크플로를 통해, 저희는 동일한 생물학적 과정을 다양한 규모에 걸쳐 조사할 수 있게 되었습니다.

이미지 제공: 몽스 대학교 Marine LUCIANO 박사 및 Sylvain GABRIELE 박사

AX 공초점 시스템을 탑재한 ECLIPSE Ji는 이전에 사용하셨던 시스템에 비해 연구 워크플로우나 결과의 품질을 어떤 면에서 개선해 주었나요? 

이 시스템을 통해 이전에는 볼 수 없었던 세부 사항을 포착할 수 있었던 실험 사례를 하나 들어주실 수 있나요?

ECLIPSE Ji-AX는 저희의 워크플로우를 획기적으로 가속화하고 간소화했습니다. 이 장비의 자동화 기능과 고성능 공초점 이미징 기술이 결합되어, 뛰어난 이미지 품질을 유지하면서도 시료 분석부터 결과 도출까지의 과정을 훨씬 더 빠르게 진행할 수 있게 되었습니다. 예를 들어, 유방 종양 스페로이드를 연구할 때, 이제 액틴 코르텍스의 구조를 명확히 파악하고, 변형이나 제한된 이동 과정에서 발생하는 미세한 세포골격 재편성을 감지할 수 있게 되었습니다. 이는 기존 시스템으로는 포착하기 매우 어려웠던 세부 사항입니다. 이는 기계적 힘과 세포 내 구조적 변화를 연결 짓는 데 있어 중요한 진전을 의미합니다.

실험실에서의 영향 및 향후 전망

- 연구실에서 널리 채택되고 있는 이 시스템이 오늘날에도 어떻게 연구를 뒷받침하고 있으며, 동시에 첨단 3D 종양 모델 개발에 새로운 가능성을 열어주고 있는지에 대해 논의합니다.

ECLIPSE Ji에 대해 팀이나 협력자들로부터 어떤 피드백을 받으셨나요?

반응은 매우 긍정적이었습니다. 연구실 구성원 모두가 Ji가 얼마나 직관적이고 사용하기 쉬운지 높이 평가하고 있으며, 신입 박사 과정생들조차 최소한의 교육만으로도 논문 게재 수준의 이미지를 생성할 수 있습니다. 또한 공동 연구자들도 결과의 속도, 재현성, 일관성에 깊은 인상을 받았으며, 특히 2D 배양, 스페로이드 및 오르가노이드를 대상으로 한 비교 연구에서 그 효과가 두드러졌습니다. 전반적으로 Ji는 우리 영상 시설에서 가장 널리 사용되는 장비 중 하나로 빠르게 자리 잡았습니다.

ECLIPSE Ji를 사용한 경험을 한마디로 요약한다면, 어떤 말씀을 하시겠습니까?

ECLIPSE Ji-AX는 지능형 자동화 기술과 최첨단 이미징 기술을 결합하여 실험실의 모든 구성원이 첨단 현미경 기술을 손쉽게 활용할 수 있도록 함으로써, 우리의 업무 방식을 혁신적으로 변화시켰습니다. 이 제품은 사용 편의성과 과학적 심도 사이에서 이상적인 균형을 이루고 있습니다.

다른 연구자들에게 니콘 ECLIPSE Ji를 추천하시겠습니까? 만약 그렇다면, 그 이유는 무엇입니까?

물론입니다. 이 장비는 3D 배양, 오가노이드, 심지어 단일 세포를 연구하는 연구자들에게 이상적이며, 장비 설정에 몇 시간을 소비하지 않고도 고품질의 영상을 얻을 수 있습니다. 이를 통해 시간을 절약하고 재현성을 높일 수 있을 뿐만 아니라, 궁극적으로 과학자들이 기술적인 복잡성보다는 새로운 발견에 집중할 수 있도록 돕습니다.

앞으로의 목표와 전망에 대해 말씀해 주시겠습니까?

저희의 목표 중 하나는 3차원 종양 스페로이드 및 오르가노이드에서 기계적 기억을 예측할 수 있는 프레임워크를 개발하는 것입니다. 저희는 곡률, 제한 환경, 기계적 응력이 세포골격과 세포핵을 어떻게 동적으로 재구성하는지, 그리고 이러한 변화가 침습적 행동에 어떤 영향을 미치는지 이해하고자 합니다. ECLIPSE Ji-AX를 활용하여 신속한 에피형광 스크리닝과 고해상도 공초점 이미징을 결합함으로써, 동일한 구상체 내에서 조직 규모의 구조와 단일 세포의 기계적 상태를 직접적으로 연관 지을 수 있습니다. 향후 몇 년 동안, 저희는 기계적 이력이 유방암의 전이를 어떻게 유도하는지 규명하기 위한 정량적 플랫폼으로서 3차원 종양 모델을 확립하는 것을 목표로 하고 있습니다.

ECLIPSE Ji는 가브리엘 교수의 연구를 지속적으로 지원하며, “연구자들이 첨단 이미징 기술을 손쉽게 활용할 수 있게 해주는 플랫폼”이라는 니콘의 비전을 구현하고 있습니다.

*각 연구자 옆에 기재된 소속 기관 및 직함은 인터뷰 당시의 소속 정보를 반영한 것입니다.
* 동영상 및 기사에 포함된 의견은 전문가/개인의 견해를 나타내는 것으로, 특정 제품의 효능, 효과 또는 성능을 보장하지 않으며, 해당 제품을 지지, 추천 또는 광고하는 것이 아닙니다.