アプリケーションと技術

Nikon BioImaging Lab -Leiden-がサポートする幅広いサービス(イメージング、解析、およびその他のツール)の概要をご紹介します。クリックして特定の項目にジャンプするか、下にスクロールしてご覧ください。

本項目は、Nikon BioImaging Lab -Leiden-で提供するアプリケーションと技術についてご紹介しています。日本でのサービスをご希望の方は、Nikon BioImaging Lab -Shonan-へお問い合わせください。


ハイコンテントイメージング(HCI)とハイコンテントアナリシス(HCA)

技術:LIPSI、ディープラーニングソフトウェアNIS.ai、細胞培養サービス

ハイコンテントイメージング(HCI)は、より多くの検出チャネルで、より多くのタイムポイントで、より多くのデータを撮影することです。創薬の表現型スクリーニングを例とするように、HCIとハイコンテントアナリシス(HCA)が、多くの研究・開発にとって強力なツールであることは広く受け入れられています。しかし、HCIの最大の強みである「豊富なデータを大量に得られること」は、一方で最大の欠点にもなります。実験デザイン、データストレージ、画像分析などに深刻なボトルネックを生じる懸念があります。Nikon BioImaging LabのHCIサービスでは、一般的なプロセスのボトルネックを解消するために、自動化に向いた柔軟なプラットフォームを使用します。

HCIは細胞の培養状態のモニタリングや毒性評価など、さまざまな用途に適用できます。スフェロイド、オルガノイド、組織、MPS/Organ-on-a-chip(OoC)などの厚みのあるサンプルをイメージングするためには、サンプルの深部でデータを取得するための共焦点顕微鏡システムを使用します。また、NIS.aiディープラーニングソフトウェアモジュールで、セグメンテーションなどの多彩な分析タスクをAIで実行することができ、自動化されたイメージングや解析パイプラインに組み込むことができます。マイクロ流体工学をベースとする細胞マニピュレーションや、細胞培養サービスも利用可能です。


3Dイメージング

技術:LIPSI、超解像顕微鏡N-SIM S、共焦点レーザー顕微鏡システムAX/AX R、倒立顕微鏡Ti2シリーズ

細胞生物学などの分野は、平面上の単層培養細胞のin vitroイメージングを活用してきました。しかし、2Dのモデルシステムの限界が徐々に認識されるようになり、スフェロイド、オルガノイド、MPS/Organ-on-a-chip(OoC)などの、より生体を反映したモデルが選択されるようになっています。3Dシステムは生物学的により良いモデルを提供しますが、相当な厚みと3D構造を持つため、これまでの2Dイメージングのアプローチでは限界があります。

ニコンの共焦点レーザー顕微鏡システムは、サンプルの数十マイクロメートル以上の深部での高速イメージングが可能な、共焦点顕微鏡システムです。

AXシリーズ共焦点システムは、比類のない3D高解像度により、優れた画質を実現。人工知能を活用することで、設定から解析までの実験手順を円滑にし、最高の使いやすさをご提供します。またAX Rは、高品質のレゾナントスキャニングによる、高速取得も実現しています。

N-SIM S超解像顕微鏡は、固定サンプルの3D多色イメージングおよび2色の同時生細胞多色イメージングに対応。X, Y, Zの全方向において、従来の光学顕微鏡の2倍の解像度を達成しています。

また、倒立顕微鏡ECLIPSE Ti2-Eは、3D蛍光イメージングにも対応し、デコンボリューションソフトウェアにより約20マイクロメートルの厚さに対応する光学セクショニングを実現します。広視野デコンボリューションによる3Dイメージングは、共焦点顕微鏡のように瞬間的に3Dセクショニングを得られる訳ではありませんが、高速かつしばしば、弱いシグナルのサンプルを撮影することに適しています。Nikon BioImaging Labでは、3Dイメージング技術における微妙な違いや適切な選択肢についてご説明することができ、お客様の成功に貢献します。

共焦点レーザー顕微鏡システムA1R HD25で取得した腎臓オルガノイドのZスタック画像。

赤:アクチン細胞骨格(F-アクチン)
青:核(DNA)


蛍光イメージング

技術:LIPSI、超解像顕微鏡N-SIM S、共焦点レーザー顕微鏡システムAX/AX R、細胞観察装置BioStudio-T、倒立顕微鏡Ti2-E

蛍光顕微鏡観察は、特定のターゲット分子を高い特異性で検出できる最も高感度なイメージング方法の1つであると広く考えられています。固定サンプルは免疫組織化学法や免疫蛍光染色法で標識されます。生体サンプルは、蛍光タンパク質を目的タンパク質に融合して発現させたり、膜透過性色素で染色して観察します。

蛍光は、多くの重要なイメージング方法を支えており、スペクトル的に異なる蛍光色素分子で様々なターゲットを標識することにより、多色イメージングが可能になります。蛍光イメージングができるように設計された顕微鏡を用いる場合でも、実験を成功させるためには考慮しなければならない多くのポイントがあります。Nikon BioImaging Labは、光毒性や蛍光色素の選択を含むサンプル調製など、実験の成功を左右する重要なポイントについてアドバイスできます。

また、Nikon BioImaging Labでご提供する画像取得システムは、ターゲットを絞ったFRAPや光刺激実験のほか、FRET解析、先進の3D共焦点イメージングや超解像イメージングにも対応しています。Nikon BioImaging Labでは、蛍光色素分子、顕微鏡の設定、封入剤などについての専門知識や経験を活かし、イメージングの成功をお手伝いします。

マウス海馬神経細胞、 緑:GFP(樹状突起)、赤:PSD-95-TagRFP(シナプス後マーカー)
対物レンズ: CFI SR HP アポクロマート TIRF 100XC Oil
画像ご協力:東京大学大学院 医学系研究科 神経細胞生物学分野、柏木有太郎先生、岡部繁男先生


高解像度イメージング

技術:超解像顕微鏡N-SIM S、共焦点レーザー顕微鏡システムAX/AX R、倒立顕微鏡Ti2-E

高品質の高解像度画像を取得するには、倍率が高い顕微鏡を使用するだけでは不十分です。ニコンのAX / AX R共焦点システムは、3Dサンプル内の一つの2D切片のみを解像できる光学セクショニングに加えて、その2D切片のサンプル特徴を高解像度でイメージングすることが可能です。共焦点システムの解像度を最大限に向上するために、Nikon BioImaging Lab ではAX Rデータを提供しています。これには、高い評価を得ているニコンの対物レンズの詳細な点像分布関数(PSF)モデルが含まれます。

また、Nikon BioImaging Labでは超解像顕微鏡N-SIM Sが使用できます。N-SIM Sは、独自の高速構造化照明を利用して最速毎秒15 フレームの取得速度を実現し、高速の生物学的プロセスを従来の光学顕微鏡の2倍の空間分解能(X, Y方向に115 nmまで、Z方向に269 nmまで)で取得できます。N-SIM Sを、A1R共焦点レーザー顕微鏡システムと組み合わせて使用することにより、一台の顕微鏡でマルチスケールの画像取得を実現する、多目的プラットフォームを構築できます。

倒立顕微鏡ECLIPSE Ti2-Eは、高解像度の多次元イメージングに対応し、共焦点システムと同様に、3Dやタイムラプス、多色などのデータを取得できます。また、解像度や光学セクショニングを向上できるデコンボリューションソフトウェアを搭載しています。

高解像度の画像を得るために必要なのは顕微鏡の準備だけではありません。同様に重要なのは、適切なサンプルの準備です。たとえば、サンプルが適切でない屈折率の媒体にマウントされている場合、特にZ方向の光学分解能が大幅に低下します。Nikon BioImaging Labでは、高解像度の顕微鏡の調整とサンプル作製の両方の専門知識により、これらの両面をカバーしています。

蝸牛繊毛のXYおよびXZ画像。解像度拡張モジュールA1-ERによるデコンボリューション前(左)と後(右)。1エアリーユニットのピンホール径を持つA1Rを用いて画像を取得。


ラベルフリー(非染色)イメージング

技術:LIPSI、細胞培養観察装置BioStation CT、細胞観察装置BioStudio-T、倒立顕微鏡Ti2-E、画像統合ソフトウェアNIS.ai

蛍光イメージングは、対象を強調して観察する最も一般的な技術の1つですが、最も侵襲的な手法の1つでもあります。蛍光色素分子は光退色しやすいことで有効寿命が限られるため、繰り返しの観察で同量の発光を励起するためには、より強い照明での励起が必要となります。
生細胞の場合、高強度の照明に対する光毒性反応によって、実験はより難しくなります。幹細胞などのセンシティブな細胞では、目的のターゲットの蛍光イメージングが思うようにできない場合があります。

細胞のダメージに対する懸念から、ラベルフリー(非染色)イメージング技術が、再び注目されています。非染色イメージングにより、高輝度照明の必要性と、標識によるアーティファクトの両方を回避できます。

人工知能をベースとした機械学習や深層学習による解析技術も、このトレンドを可能にしています。たとえば、Convert.aiモジュール(NIS.ai深層学習ソフトウェアモジュールの1つ)は、この画像の疑似DAPI染色のように、主要な細胞の特徴を非染色画像から自動的に識別することができます。Nikon BioImaging Labでは、定量位相、位相差、微分干渉(DIC)、暗視野、明視野などの技術を使用して、ラベルフリー(非染色)のイメージングをサポートしています。お客様の観察対象に対して、ラベルフリーイメージングが効果的かどうかをご確認いただくために、お気軽にお問い合わせください。

Convert.ai適用画像
オリジナル画像

核のDAPI染色は細胞のカウントやセグメントの一般的な方法ですが、Convert.aiは、DIC画像や位相差画像において、DAPI標識の場所を予測するよう学習できます。予測した観察像を使用してセグメントやカウントが行えるため、DAPI染色や蛍光撮影を行う必要がありません。

画像ご協力:北海道大学電子科学研究所技術部 小林健太郎先生


細胞スクリーニング

技術:LIPSI、共焦点レーザー顕微鏡システムAX/AX R、細胞観察装置BioStudio-T

幹細胞は、再生医療や関連分野に不可欠なツールですが、環境に敏感なため、未分化状態での培養や維持が難しいことが知られています。Nikon BioImaging Labでは幹細胞(およびその他の困難な細胞タイプ)の培養課題に対処するために、自動培養顕微鏡イメージングシステムを使用しています。これは、敏感な細胞培養を長期間モニタリングするために一から開発された、インキュベーターに内蔵された顕微鏡システムです。このシステムは、自動画像取得、超精密な容器交換(2つの容器に最大20個のウェルプレート)、幹細胞コロニーの自動識別やカウントなどのさまざまな解析を実現する、AIベースの深層学習ソフトウェアツールを備えています。

BioStudio-T は、敏感な細胞培養を長期間モニタリングするために一から開発された、インキュベーター内に収まる、単一容器のためのコンパクトな顕微鏡イメージングシステムです。サンプルを静止状態に保ったまま、対物レンズが対象をスキャンすることで、細胞への影響を低減できます。

自動培養顕微鏡イメージングシステムは、多くの細胞スクリーニング機能を有します。また、搭載された共焦点レーザー顕微鏡システムにより、生体サンプルの数十マイクロメートルの深さまで鮮明にイメージングできるため、深部イメージングなどの特定のケースに適しています。Nikon BioImaging Labではイメージングだけでなく、細胞培養の開始からデータ解析やプロセスの改良まで、完全な細胞スクリーニングアッセイの開発をお手伝いいたします。

位相差画像による非染色解析

赤:未分化細胞
緑:分化細胞


ハイスループット

技術:LIPSI、共焦点レーザー顕微鏡システムAX/AX R、倒立型顕微鏡Ti2-E

ハイコンテントイメージング(HCI)およびハイコンテントアナリシス(HCA)が、詳細な多変量データの取得と選別に重点を置いている一方で、ハイスループットはたとえデータの次元が低くても、データ量に重点を置いています。ただし、これはHCIとHCAがハイスループットで行えないことを意味するものではありません。

自動培養顕微鏡イメージングシステムと倒立顕微鏡Ti2-Eは、カメラポートを通る25 mmの広視野(FOV)を備えており、競合する顕微鏡システムと比較して約2倍のイメージング領域が得られます。これらのシステムは、視野数25 mmに対応するニコンの大判カメラや共焦点システムと連携し、非常に高いスループットを提供します。スループットは、イメージング領域だけでなく、取得速度によっても決定します。倒立顕微鏡Ti2-Eは、高速トリガー取得を採用し、カメラからの発射信号によってシステム機器の機能を直接トリガーできるため、ソフトウェアによる低速の制御を回避できます。共焦点システムは、高速レゾナントスキャンを選択できるため、15フレーム/秒(2048 x 1024画素)の高速でのフルフレームイメージングが可能です。ディープラーニングをベースにしたノイズ除去ソフトウェアモジュールDenoise.aiと連携し、低速スキャンシステムと同等の高画質をリアルタイムに実現します。

マルチポイント取得や画像タイリングは、ここで説明するすべてのシステムとともに、NIS-Elements ソフトウェアの画像取得ワークフローに簡単に組み込むことができるため、ウェル全体や、スライド全体、容器全体のイメージングが容易に行えます。

マウス胚、HE染色
自家蛍光画像のつなぎ目のない画像タイリング
対物レンズ:CFIプランアポクロマート Lambda 10X


臓器チップ撮影・解析受託サービス

創薬の分野では、新薬候補となる化合物の有効性や安全性の評価、生体現象の再現に細胞や生体組織が用いられています。治験薬としてヒトに投与し、有効性や安全性を確認するまでには、数多くの試験を繰り返すなど、膨大な時間とコストを必要とします。

臓器チップ(オーガンチップ、OoC)は、臓器由来の細胞をチップ上の微細な流路の中で培養し、生体内の臓器を模倣したもので、高精度かつ効率的に化合物の有効性や安全性を評価できる画期的な技術です。その一方で、複雑な構造を持つ臓器チップの撮影や解析条件の選択、定量的なデータ取得を行うには、熟練した技術が求められます。ニコンは、主要な臓器チップメーカーと連携し、それぞれの臓器チップや実験目的に適した撮影・解析方法を確立しています。

Nikon BioImaging Labでは、お客さまの委託に基づき、創薬の研究開発用途に応じた最適な方法で、臓器チップを撮影・解析いたします。

臓器チップ撮影・解析受託サービスの流れ

*1 本サービスは、細胞播種・染色・固定していただいた臓器チップサンプルを対象とさせていただきます。

NBILで利用可能なサンプル

Emulate Chips
Emulate PODs
Mimetas Organoplates
AIM Biotech Chips
Nortis Chips
Tissuse Chips

サービスの費用や詳細については、お問い合わせください。